当夜，于陈氏和林元应来到府衙天牢探监，见到王香娥头和手都套在枷锁里，脸如白纸，浑身血污。于陈氏遭遇丧子大祸，也仿佛老了二十年一样。
林元应说：“香娥，婆婆看你来了……”
王香娥睁开眼睛，有气无力地说：“婆婆……我身上很疼……您老人家好吗?”
于陈氏说：“州府说你与和尚合谋杀害我的孩儿，证据确凿，我只是来看看你，想知道是不是真的?”
王香娥凄苦地一笑，道：“若婆婆都不相信我，我还有什么话可说呢?天日昭昭，小女子从来没有干过对不起于家的事啊……”
林元应叹口气说：“事已至此，香娥，君甫既然已死，你也不必强撑着了。婆婆给你的金如意怎么会在那和尚屋里呢?你若不说，天下谁人知道?”
王香娥幽怨地说道：“金如意不是我送给和尚的，是我弄丢了，和尚捡到的。”
于陈氏低头垂泪，突然抬起头来说：“王香娥，无论如何，你都是于家的人。你如果真的冤枉，丢了金如意的事，为何不见你象我提起过?”
王香娥说：“我是怕婆婆生气伤心，不敢提起……”
于陈氏说：“我和君甫都待你不薄。君甫人虽任性，但也是个好人，你为何还要……”
王香娥委屈已极，“呜呜”痛哭起来，好久一会儿才昂起头来说：“婆婆，您们对我好我就会害死您们了!”突然发了疯似的大吼道：“是我杀的!是我杀的!”这时，两名狱卒冲进来，骂道：“犯妇竟敢猖狂!”用力将王香娥打倒在地，再也无法出声。
于陈氏与林元应相对无言，默默转身走了回去。
又过了七天，王香娥和释能两人仍是口中称冤。知府洪明镜与捕快们商量，两人通奸谋杀之罪无容置疑，若不动用酷刑，恐怕难得落罪，所以便直接在天牢内动刑。
动用了十几套刑具，两人哭叫哀嚎，死去活来。王香娥当夜呻吟了一宿。第二天狱卒送了一些米饭进来给她吃，王香娥不吃。狱卒破口大骂道：“你这丧尽天良的贱人!几天都不吃，就是想死也把罪给认了再死吧!”王香娥摇了摇头，过了一会才问狱卒要水喝，那狱卒叹了口气，出去拿了一碗清水进来，王香娥捧过来，咕嘟咕嘟地喝了个精光，喘了半天气，然后把身上被烙铁烧焦几乎脱落的皮肉上撕下一块来，放进嘴里咀嚼，吞了下去之后，说道：“官爷，民妇愿意招供……”狱卒们大喜过望，很快的就帮王香娥在罪书上画了押和按了手指模。那边厢释能和尚激愤交加，对狱卒破口大骂。当被告知王香娥已经供认了通奸杀人之罪时，仰天吼叫：“贫僧不求一生，但求速死，决不认罪!”说着，两道血水从眼中流下，竟然双目失明了。结果被狱卒们把他的手抓住，也在认罪书上画了押和按了指印。
自此，案件了结。洪明镜知府在苏州府衙正式宣判，和尚释能和民妇王香娥通奸杀人罪成立，按照大明律例，处以斩首极刑，秋后执行。
临刑前的半个月。于陈氏和林元应再次来到大牢里看望王香娥。
王香娥气色反而闲定下来，只是面容憔悴，神情呆滞。林元应问：“香娥，你还有什么话说吗?”王香娥失神地望着他，说道：“我爹爹呢?他怎么没来看过我?”林元应说：“你爹爹不愿相信你有罪，关了豆腐店回乡下去了。你放心吧，他没事。”
王香娥“唉”了一声，转对于陈氏说：“婆婆，我昨晚梦见相公了，他对我说，他在下面很好，等着我去相聚了。”
于陈氏安详地说道：“香娥，我不怪你。只怪我家平时不烧香磕头，得罪了神灵，该有此劫。应该说是我们于家对你不住。”
王香娥流下泪来，茫然地说：“我王香娥生是于家的人，死是于家的鬼。天上若有神灵，也会知道我没有对不起于家的。”
于陈氏与林元应黯然无语。
王香娥突然唱起歌儿来：“花儿开了蝴蝶飞啊，春风薰得鸟儿醉，姑娘回家采桑叶……”二人见她眼神空洞，衣衫破碎，不忍心再看，匆匆离开了苏州府衙天牢。