第二天升堂，海瑞宣布：“真凶已有线索，梁新无罪，当堂释放。”
消息立刻传遍了全县，石丰听到这个消息后，直奔县府官邸而来，见了海瑞便问道：“海大人，为何释放那杀人凶犯梁新？”海瑞道：“你何以证明梁新为杀人凶犯？”石丰怒声道：“梁新浑身鲜血，手持带血凶器在杀人现场，不是他是谁？”海瑞摇头道：“仅凭这些说明不了什么，据察，死者致命伤在脑部，刀口仅一寸多长，却深及脑髓。依我之见，凶器乃是一柄匕首。而当时梁新身上未佩带匕首，后花园内及附近也并未找到匕首，故而我认为凶手另有他人。”石丰沉默半晌，说道：“那么海大人何时捕获真凶，为我儿报仇？”海瑞道：“三日之内。”
却说梁新回到家中，一家人自是欣喜异常，直赞海瑞海青天。他没有忘记海瑞所交代的事情，可是一天过去了没有动静，第二天仍然没有人来打探案情。第三天一早，梁新独自来到市集。忽然觉得后面有一个贼头贼脑的青衣人在跟踪他。梁新不动声色地走进一家小酒馆，点了几样小菜和二两白酒，独斟独饮起来。这时，那个青衣人来到梁新身边坐下。梁新认出他是历城县的一个地痞，姓王名十六，平素偷鸡摸狗，坏事干尽。梁新抬头看了眼王十六，并未理会，仍旧
独斟独饮，王十六转头喊道：“掌柜的，今天大爷付账，好酒好菜尽管上来。”喊罢，低声赔笑问道：“梁兄，我想向你打听个事儿。”梁新瞟了一眼王十六，淡淡地说：“什么事？”王十六凑近梁新悄声道：“听说县府已抓住了杀死石靖堂的凶手？”梁新饮下杯中酒，突然一拍桌子，起身抽出随身腰刀，厉喝道：“就是你。”那王十六闻言面色大变，慌忙起身操起一张长凳砸向梁新，可他哪是梁新的对手，没打几个回合，就被梁新打翻在地。梁新找来一根绳子，将王十六捆绑结实，然后押往府衙。
海瑞闻讯，立即升堂审问。大堂之上海瑞一拍惊堂木，道：“王十六，那石靖堂是不是你所杀，你要从实招来，否则本县定不饶你。”王十六早已吓得魂不附体，只好乖乖交代了自己的杀人罪行。
原来，在石靖堂成婚的那天晚上，王十六翻入石府，本欲趁乱偷些东西。谁料他刚翻入石府后花园，石靖堂也恰好来到后花园，二人相遇，石靖堂忙大声呼叫，王十六慌乱间抽出随身携带的匕首，刺向石靖堂的脑部，然后仓皇而逃。
此时，梁新闻声赶来，随后众家丁赶来，便出现了误抓凶手的那一幕。
石府杀人案终于真相大白，凶手被正法，梁新也洗清了冤屈。历城县百姓纷纷赞叹海瑞办案精细。
以上就是海瑞办案