“续编”和“三编”基本沿承“初编”，但文字上不再分为上等、次等，更加详尽。据记载，“三编”在文献征引方面，引用书籍达160余种。入“续编”作品除沿用钤盖“初编”之“五玺全”外，还要加钤“石渠定鉴”、“宝笈重编”二印，以示区分，称为“七玺全”。此外，再加钤贮藏地殿座章，称为“八玺全”。入“三编”作品，将“五玺全”中的“乾隆御览之宝”、“乾隆鉴赏”改为“嘉庆御览之宝”、“嘉庆鉴赏”，依然为“五玺全”，并加钤“宝笈三编”，以示区别于前两编。
除鉴藏体制完备的钤印制度，经内府收藏、《石渠宝笈》著录的书画作品还具有其他明显的皇家收藏特点：重新装潢，并大多有乾隆皇帝及词臣们的题识。在内容上，《石渠宝笈》不仅著录晋唐以来的法书绘画名迹，也将本朝皇帝、宗室、臣工的书画作品罗列于内。“续编”较“初编”，增加了历代法帖丛刻，涉及典章制度的诸大事件的宝贵实录绘画，如“南巡”、“交战”等图，以及部分西洋画都在其中。“三编”搜罗更广，包括书画、碑帖、缂丝、图像等品类。
本次“特展”的近200件作品，都是精选之作，分为两个部分：“典藏篇”放于武英殿，以三个单元介绍著录于《石渠宝笈》的书画珍宝的鉴藏、流传及辨伪情况；“编纂篇”放于延禧宫，从五个单元展示《石渠宝笈》编纂成书的方方面面。这样的展览结构，围绕著录典籍的特点，将书画作品、文献佐证结合呈现，希望让普通观众和专业人士都能找到令他们激动的视点。
特展典藏部分的“皇室秘赏”，都是晋唐至明清法书绘画名迹，件件绝世珍品。东晋王珣《伯远帖》，入《石渠宝笈》“初编”，为已知确认为晋人书迹的唯一作品，在书法史上的价值非常高。此帖是王珣想念友人的一封书信，文辞简练，意境怅惘，书迹古淡天然，晋人风度。乾隆皇帝非常喜爱这件作品，将它与王羲之的《快雪时晴帖》、王献之的《中秋帖》并称“三希”，置于养心殿温室，称为“三希堂”。经后人研究，“三希”中，二王父子作品皆为后代书家临仿，唯有这件《伯远帖》真迹无疑，它的价值就更加不言而喻了。
隋代展子虔的《游春图》是标志中国山水画趋于成熟的开山肇始，入“续编”。画作绘春日光景，佳客游山玩水，山石有钩无皴，青绿填色，泥金晕染，整体布局已经克服了早期表现山水时“人大于山，水不容泛”的毛病，画境非常自然生动，颜色古艳明媚，为“金碧山水”。此图没有名款，但在画前有宋徽宗瘦金书：“展子虔游春图”，因而得名。
唐冯承素摹《兰亭序》，为“兰亭八柱”之三，被认为是最接近王羲之原作的双钩摹拓本，入“续编”。目前已知王羲之并无真迹存留，赏“冯摹兰亭”，可神会“翩若惊鸿，婉若游龙”的王书之妙。有了王羲之这一篇优美的文辞，又有这一篇在书法史上无法逾越的绝世之作，中国人的精神领域里就有了永远无法被替代的一块专属之地，围绕它的创作、研究、雅集、唱和层出不穷并绵延历代，那就是“兰亭”文化。