将硬盘由FAT16转为FAT32。
3、不要轻易使用背景
不要使用ActiveDesktop，否则系统运行速度会因此减慢(右击屏幕→寻显示器属性→Web标签→将其中关于“活动桌面”和“频道”的选项全部取消)。
4、设置虚拟内存
自己设定虚拟内存为机器内存的3倍，例如：有32M的内存就设虚拟内存为96M，且最大值和最小值都一样(此设定可通过“控制面板→系统→性能→虚拟内存”来设置)。
5、一些优化设置
a、到控制面板中，选择“系统→性能→文件系统”。将硬盘标签的“计算机主要用途”改为网络服务器，“预读式优化"调到全速。
b、将“软盘”标签中“每次启动就搜寻新的软驱”取消。
c、CD-ROM中的“追加高速缓存”调至最大，访问方式选四倍速或更快的CD-ROM。
6、定期对系统进行整理
定期使用下列工具：磁盘扫描、磁盘清理、碎片整理、系统文件检查器(ASD)、DrWatson等。
二、Windows2000
1、升级文件系统
a、如果你所用的操作系统是win9x与win2000双重启动的话，建议文件系统格式都用FAT32格式，这样一来可以节省硬盘空间，二来也可以9x与2000之间能实行资源共享。
提醒：要实现这样的双重启动，最好是先在纯DOS环境下安装完9x在C区，再在9x中或者用win2000启动盘启动在DOS环境下安装2000在另一个区内，并且此区起码要有800M的空间以上
b、如果阁下只使用win2000的话，建议将文件系统格式转化为NTFS格式，这样一来可节省硬盘空间，二来稳定性和运转速度更高，并且此文件系统格式有很好的纠错性;但这样一来，DOS和win9x系统就不能在这文件系统格式中运行，这也是上面所说做双启动最好要用FAT32格式才能保证资源共享的原因。而且，某些应用程序也不能在此文件系统格式中运行，大多是DOS下的游戏类。
提醒：在win2000下将文件系统升级为NTFS格式的方法是，点击“开始-程序-附件”选中“命令提示符”，然后在打开的提示符窗口输入"convertdrive_letter:/fs:ntfs"，其中的"drive"是你所要升级的硬盘分区符号，如C区;还需要说明的是，升级文件系统，不会破坏所升级硬盘分区里的文件，无需要备份。
·再运行“添加-删除程序”，就会看见多出了个“添加/删除Windows组件”的选项;
b、打开“文件夹选项”，在“查看”标签里选中“显示所有文件和文件夹”，此时在你安装win2000下的区盘根目录下会出现Autoexec.bat和Config.sys两个文件，事实上这两个文件里面根本没有任何内容，可以将它们安全删除。
c、右击“我的电脑”，选中“管理”，在点“服务和应用程序”下的“服务”选项，会看见win2000上加载的各个程序组见，其中有许多是关于局域网设置或其它一些功能的，你完全可以将你不使用的程序禁用;
如：Alertr，如果你不是处于局域网中，完全可以它设置为禁用;还有FaxService，不发传真的设置成禁用;PrintSpooler，没有打印机的设置成制用;UninterruptiblepowerSupply，没有UPS的也设置成禁用，这些加载程序你自己可以根据自己实际情况进行设置。
各个加载程序后面都有说明，以及运行状态;选中了要禁用的程序，右击它，选“属性”，然后单击停止，并将“启动类型”设置为“手动”或者“已禁用”就行了
d、关掉调试器Dr.Watson
运行drwtsn32，把除了“转储全部线程上下文”之外的全都去掉。否则一旦有程序出错，硬盘会响很久，而且会占用很多空间。如果你以前遇到过这种情况，请查找user.dmp文件并删掉，可能会省掉几十兆的空间。这是出错程序的现场，对我们没用。另外蓝屏时出现的memory.dmp也可删掉。可在我的电脑/属性中关掉。