一、USB-HDD+：(占用1个扇区)增强的USB-HDD模式，DOS启动后显示C:盘，兼容性极高。其缺点在于对仅支持USB-ZIP的电脑无法启动。
电脑启动后首先读取此MBR，然后从指定的激活主分区启动，读入PBR引导扇区，再由引导扇区指定的引导文件，从而启动系统或PE或GRLDR等。。。。
引导过程为：MBR → 分区PBR → 引导文件
二、USB-HDD：(占用1个扇区)硬盘仿真模式，DOS启动后显示C:盘，HP(惠普) U盘格式化工具制作的U盘即采用此启动模式。此模式兼容性很高，但对于一些只支持USB-ZIP模式的电脑则无法启动。
电脑启动后首先读取此MBR，然后从指定的激活主分区启动(所以你要启动的分区必须激活，且有指定的引导文件存在)，读入PBR引导扇区，再由引导扇区指定的引导文件，从而启动系统或PE或GRLDR等。。。。
常见引导过程为：MBR → 分区PBR → 引导文件(如：XP的NTLDR，VISTA的BOOTMGR ，GRUB的GRLDR。)
三、USB-ZIP：大容量软盘仿真模式，DOS启动后显示A盘，FlashBoot制作的USB-ZIP启动U盘即采用此模式。此模式在一些比较老的电脑上是唯一可选的模式，但对大部分新电脑来说兼容性不好，特别是大容量U盘。
引导过程为：分区PBR → 引导文件
四、USB-ZIP+：：(占用1个扇区)增强的USB-ZIP模式，支持USB-HDD/USB-ZIP双模式启动(根据电脑的不同，有些BIOS在DOS启动后可能显示C:盘，有些BIOS在DOS启动后可能显示A:盘)，从而达到很高的兼容性。其缺点在于有些支持USB-HDD的电脑会将此模式的U盘认为是USB-ZIP来启动，从而导致4GB以上大容量U盘的兼容性有所降低。
引导过程为：MBR → 分区PBR → 引导文件
五、 USB-FDD: 是指把U盘模拟成软驱模式，启动后U盘的盘符是A:，
引导过程为：分区PBR → 引导文件
六、USB-CDROM：光盘仿真模式，DOS启动后可以不占盘符，兼容性比较高，新老主板一般都可以。优点可以像光盘一样使用(如，进行Windows系统安装)。缺点，把U盘量产成该模式时，我们将失去对这部分U盘空间的写权利，剩余空间会被识别成为一个独立的U盘，可以为Removable盘，当然也可以做成Fixed盘，进一步分区。制作时一般需要具体U盘型号/批号所对应的量产工具来制作，对于U盘网上有相应的量产工具。
七. NT 5.x: (占用1个扇区)此MBR依然是从激活的主分区启动，遇到多个激活分区就报分区表错误。
引导过程为：MBR → 分区PBR → 引导文件
八、 NT 6.x： (占用1个扇区)此MBR依然是从激活的主分区启动，支持多个激活分区，从第一个激活分区启动。
引导过程为：MBR → 分区PBR → 引导文件
九、PLoP Boot Manager(占用62个扇区)* 支持 USB 磁盘启动，其一是从 USB 介质上启动，也能转入到 USB 介质启动(无论 BIOS 是否支持 USB 启动)。从开发日志上看，对于 EHCI/OHCI/UHCI 三种接口是都支持的，但外接 USB HUB 还不支持。这个功能，的确激动人心，虽然之前看 Filo 里面有 USB 栈，是保护模式下的，而这个是实模式下的。 * 支持光盘启动这个是两层意思: 既能从光盘上启动，也能从其他介质启动后转入光驱启动。* 超小体积和对图形界面的支持，只有 40-50kb 的个头，但是能实现 USB 栈，和 cdrom mini 驱动的确是个奇迹，而它还包括了图形支持与启动特效。
十、FBINST: (占用64个扇区)FBINST 在MBR的每个扇区(前64扇区)都写入了引导代码，并在每个扇区记录扇区号，这样无论U盘被识别为何种格式，都可以正常启动，启动的时候需要在1~64扇区读取计算好的信息，电脑就可以迅速而正确地获得参数，从而引导UD区的GRLDR，使得电脑正常启动。。。
引导过程为：MBR → UD区 → 引导文件
十一、GRUB4DOS：(占用18个扇区，老版本占用16个扇区)是强大的引导程序，可以安装在MBR ，也可以安装在分区 PBR ，若安装在MBR，则可以搜索所有分区，启动其指定文件-GRLDR(不需读入分区PBR)，从而正常启动。
引导过程为：MBR → grldr