在晴朗明媚的一天，羊村正举行防御系统揭幕仪式，这是慢羊羊村长的最新发明，该系统可以抵制上千伏的电压。谁知这时灰太狼突然出现搅局，不久前他发明了羊味罐头，由此成为当今最炙手可热的科学家，可是没能抓到小羊依然是他心中隐隐的伤痛。灰太狼操纵天气控制器与羊羊特工队展开殊死搏斗。受伤的喜羊羊偶然结识了熊猫旺财，而对方的真实身份是灭绝了许久的蛇。受挫的灰太狼专心升级天气控制器，却忽略了老婆和灰灰的感受，而他的失误也导致天气控制器失控。危难时刻，青青草原的各位意外发现久远以前蛇族发明的诺亚神舟。可是为了启动神舟，必须得到蛇族的帮助。为此，羊羊特工队和机械喜羊羊踏上凶险莫测的冒险旅程。
灰太狼：你们几个变大了，就以为我认不出来了吗？火力准备！
包包大人：慢羊羊，怎么办呢？
慢羊羊：羊羊特工队！
小灰灰：懒羊羊哥哥，你怎么了？
懒羊羊：快看，这只动物和我的发型多像!
慢羊羊：如果我没猜错的话，它应该就是传说中的神舟。
喜羊羊：小闪电！
喜羊羊：谢天谢地，我们也差点被你解决了。
灰太狼：为什么和平常的老婆不一样？你生病了吗？（被老婆平底锅伺候后）老婆又变回正常了 。
蛇爸：这种老古董，拍它两下就好了！
蛇妈：没关系，看我给你来个七十二变！
灰太狼：我说老婆，动手别动锅呀！
灰太狼：为了儿子，只能顶风作案了！
红太狼：可是，你的样子还在天气们的通缉排名单上啊！
灰太狼：所以说是顶风作案嘛！
喜羊羊：把他抬上神舟！
灰太狼：好歹也救了我才走啊！
红太狼：老公！
灰太狼：老婆！
喜羊羊：村长，小心啊！
灰太狼：好玩吗？游戏才刚刚开始呢！
包包大人：他是青青草原唯一的蟑螂了！
蟑螂：信不信我死给你们看？
蟑螂：我叫蟑螂，不叫小强！
彪哥：信彪哥，得永生。
彪哥：小心我给你点颜色看看。