也有学者认为，贝加尔湖中的淡水类海洋动物，原先生活在海洋中，以后不安于海洋生活，进入叶尼塞河，并不断地向河流上游运动，最终到达贝加尔湖，逐渐习惯了在淡水中生活，繁衍后代，便形成了在淡水湖中的“海洋动物”。
贝加尔湖是世界最古老的湖泊之一，是由印度板块和欧亚板块碰撞形成的,绝大多数科学家都认为贝加尔湖深处特有的动物残遗种约形成于三千万年前到两千万年前。贝加尔湖的产生据说是因为亚洲地壳沿着一条断层慢慢拉开，出现了一条地沟。起初，这条地沟深八公里，但随着岁月流逝逐渐被淤泥填塞，从淤泥中的微生物化石可以显示其形成年代。 绝大多数的湖泊，特别是冰河时期的湖泊，都形成于一万五千年前到一万年前。然后这些湖泊渐渐被沉积物填满，变成季节性沼泽、沼泽，最后彻底干涸。最近的研究表明贝加尔湖不是一个即将消失的湖泊，而是一个出于初始期的海洋。和非洲大陆以及南美大陆的地中海和红海一样，贝加尔湖的湖岸每年以两厘米的速度向两边拉开。贝加尔湖拥有作为许多海洋的典型特征——深不可测、巨大的库容、暗流、潮汐、强风暴、大浪、不断变大的裂谷、地磁异常等等。贝加尔洼地是不对称的，西部的坡面比东部更加陡峭。
从地质构造上看，贝加尔湖是一个断谷的凹部，一个深入到地下15至20公里深处的大裂口。贝加尔湖和它的汇水区是世界上一个独特的地质体系。贝加尔湖位于西伯利亚东部中心地区，接近亚洲的地理中心。贝加尔湖的山谷洼地是西伯利亚地区重要的自然屏障。这一自然屏障将不同的动植物区分开，在这里生长着许多独特的生物群落。
46亿年前地球形成之后，在39亿年前，空气中的水蒸汽凝结成水珠降回地表形成海洋，这时的海洋覆盖这整个地球，深度1.2万米。5.2亿年前，由于地球发生了大的膨裂，海水流入地壳的裂缝，海水从大陆上逐步退出，大陆逐渐露出海面，一些海洋生物就留在了大陆上低洼地区的湖泊里。5.2亿年前的海水是咸的，因此贝加尔湖的湖水也是咸的，但由于大量的雨水、河水不断流入贝加尔湖，湖水逐渐变淡。一些在海洋咸水中生存的海洋生物，逐渐适应了贝加尔湖中的淡水环境。从上述可以看出，虽然贝加尔湖中生代时是陆地，可是在古生代是海洋，因此贝加尔湖中的海洋生物是古海洋的海退遗种。
南美洲的的的喀喀湖也有海洋生物，它们也是古海洋的海退遗种。的的喀喀湖虽然位于高原之上，但湖泊四周地区却出现数以百万计的海洋贝壳化石。这个现象显示很久以前，这里的高原应该还是在海底，由于地壳的变动，被迫推挤上升。虽然地壳的变动已是相当久远之前的事，但是现在的的的喀喀湖中仍然存在着海洋生物。渔夫在湖中仍然可以网到海马，还有属于海洋生物的绿钩虾及贝类。