恐怖分子走了过来，让达维德和其他观众回到二层看台，让他们坐下。与此同时，这名恐怖分子的同伴还在继续向一层的人群疯狂扫射。就在此时，剧院外的警方谈判人员开始通过剧院的窗子与恐怖分子交涉，并提出等待20分钟的要求，恐怖分子同意了。“太不可思议了，就像电影一样，恐怖分子有武器，可以随便开枪，但他们却同意在窗边谈判。”达维德后来想。
35岁的皮埃尔（Pierre Janaszak）是和朋友一起去看的演出，他幸运地买了二层看台的票，扫射开始后，他和另外四个人躲进了二层看台的厕所中。他不敢出来，但他听到恐怖分子说一共有二十几名人质，恐怖分子还通过窗户和警方谈判。“我清楚地听到恐怖分子对人质说：‘这是奥朗德的错，是你们总统的错，就不应该介入叙利亚。’他们还提到了伊拉克。”
接近凌晨1点，警察的营救行动开始了。特警部队从John他们一行人逃生的那扇天窗进入剧院。光火四溅，子弹横飞，特警攻入了剧院，其中三名恐怖分子引爆了自己身上的自杀炸弹，另一名被警方击毙。随后控制局面的警察把二层厕所的门打开，皮埃尔和其他人被要求脱去上衣撤离，确保他们身上没有自杀炸弹。
最终特警部队只救出了十几名被绑架的人。躲在屋顶上的人通过消防车伸出的云梯获救。巴塔克兰剧院至少80人死亡。大部分获救的人都没穿大衣，裹着铝制保温毯，在街上接受治疗和问询。一名救援人员从剧院走了出来，他说：“里面的惨状完全就是一场屠杀，但我们不能移动这些尸体，那是重案组的工作。”
警方疏散了周边的餐馆和酒吧，巴黎市长伊达尔戈、法国总统奥朗德、总理瓦尔斯陆续赶到现场。发表声明、与警力部队会面、缅怀逝者，法国经历了国家历史上最严重的恐怖袭击，但一切又都像似曾相识，1月7日的《查理周刊》袭击事发的编辑部离巴塔克兰剧院只有500米。
伊斯迈尔·奥马尔·穆斯塔法
恐怖分子引爆自杀炸弹身亡，一段被炸飞的断指在现场被找到，从而确认了剧院内一名恐怖分子的身份。他叫伊斯迈尔·奥马尔·穆斯塔法。1985年出生在巴黎郊区，阿尔及利亚移民的后代。穆斯塔法有两个兄弟、两个姐妹。2004至2010年间，穆斯塔法先后因无证驾驶、伤害风化、贩毒等嫌疑被8次起诉，但都躲过了牢狱之刑。第二代穆斯林移民、巴黎郊区问题少年，这些身份与年初《查理周刊》和犹太超市两次事件的始作俑者有着相似的人生经历。
穆斯塔法2010年便被法国情报部门以伊斯兰极端化列入国家安全档案，但从没有因与恐怖分子联系而被纳入重点跟踪档案。穆斯塔法最近几年搬去了巴黎西南不远的夏特尔市。夏特尔市长让-皮埃尔·乔治说：“自从2012年起，他在夏特尔市就没什么动静了，也没有工作登记。”穆斯塔法曾经住过的住宅附近的居民说，他两三年前就离开了这里。法国情报部门2013年秋天在土耳其发现了他的行踪，那是去叙利亚的必经之地。人们再次看到他，是2014年春天在夏特尔市的一个伊斯兰极端主义团体的聚会上，法国情报部门只把他归为“团体中的简单成员”。后来一名摩洛哥裔的伊斯兰信徒经常从比利时到夏特尔市，穆斯塔法与他一同布道。如今穆斯塔法的父亲和哥哥均已被法国警方逮捕，调查还在继续。