2014年的中央一号文件开始强调完善粮食等农产品的价格形成机制，首次提出了农产品目标价格机制度。目标价格机制是上世纪70年代西方发达国家保护农业生产的主要办法，政府事先对农产品设定一个目标价格，农民完全按照市场价格销售农产品，当市场价格低于目标价格时，政府按差价对农民进行补贴，当市场价格高于目标价格时，政府对低收入消费者进行补贴。目标价格的好处在于政府不再对价格进行直接干预，使得农产品以市场化定价，这样避免扰乱农产品内在的市场运行机制，使得市场在农业生产的资源配置中发挥决定性作用，减少农业生产长期以来的市场失灵。同时政府对农民和低收入人群进行两头补贴，也避免了过去农产品保护价收购政策下带来粮食价格持续上涨，对城市低收入人群带来生活压力。2014年以来，我国开始启动东北和内蒙古大豆、新疆棉花目标价格补贴试点，探索粮食、生猪等农产品目标价格保险试点，同时继续执行稻谷、小麦的最低收购价政策和玉米、菜籽油、食糖临时收储政策。
与目前的最低收购价和临时收储政策等相比，农产品目标价格制度显然更具优势，但也并不意味着可以就此解决农产品的价格难题，一是因为农产品的目标价格如何制定是一个相当复杂的系统工程，过低无法有效保护农民利益，过高则会对财政带来巨大压力。其次，农产品目标价格制度虽然相比过去的托市政策更为市场化，但终究还是属于补贴制度，某种程度上，这和目前全球贸易的高标准背道而驰。目前全球贸易正处于一轮重新洗牌的前夜，美国刚刚在亚太地区建立了高标准的TPP，对于中国而言，如果想要抗衡TPP带来的冲击，在新一轮的双边和多边自贸区谈判中，也必须以尽可能高的贸易标准予以回应，而这必然会对国内的补贴政策带来冲击，制约农产品的补贴空间。从2014年启动的棉花和大豆目标价格试点来看，实行一年多来也是暴露了不少问题，原本计划将试点扩围至食糖等农产品，最终也并未扩围，而是将试点范围继续控制在棉花和大豆两个品种，显示出目标价格试点的复杂性超出想象。
今年三大主粮价格下跌，就使得农产品价格改革更陷入两难之中。如果政府不采取更有力度的保护政策，任由粮价继续下跌，农民的种粮积极性就会受到打击，不仅使得农民利益受损，更可能危及粮食安全，随着这一轮粮价下跌，已经开始出现一些土地流转大户因为亏损而弃租毁约的现象，如果这种现象大面积蔓延，我国粮食连续十几年的增长势头可能会就此终结。我国粮食虽然连年增产，但由于消费量的增长，粮食供求也始终只是维持紧平衡的局面，一旦粮食增长局面被打破，粮食供求关系可能会发生逆转。但从更长远来看，如果政府为了稳定短期粮价下跌而重回托市老路，只会使得目前粮食市场的价格扭曲更加严重，而且未来的托市成本会越来越高，终究也是难以为继。
对于农产品实行政府补贴一向是全球惯例，不过具体如何补贴则大有不同。在WTO规则下有所谓的黄箱补贴和绿箱补贴之别，如果政府直接对农产品实行价格补贴视为黄箱补贴，对此有严格的上限规定，而如果政府对农产品基础设施加大投入，提高农业生产的科技含量等则视为绿箱补贴，对此世贸规则下不设补贴天花板。对于中国农业而言，忍受短期的转型阵痛，加大农业的科技投入，提高中国农业的长期竞争力或许才是真正的出路。