史书记载秦越人著有《扁鹊内经》、《扁鹊外经》，但都失传了。还有一本《难经》据说是他所作。唐代杨玄操在《〈难经〉序》中写道，《黄帝八十一难经》是勃海秦越人托名黄帝所写，“以其与轩辕时扁鹊相类，乃号之为扁鹊，又家于卢国，因命之曰卢医”。
照这种说法，在“扁鹊”名号之外，秦越人还被时人根据他的出生之地赠与了一个名字：卢医。
据说扁鹊最后死在秦国。“扁鹊名闻天下。过邯郸，闻贵妇人，即为带下医；过雒阳，闻周人爱老人，即为耳目痹医；来入咸阳，闻秦人爱小儿，即为小儿医；随俗为变。”出函谷关的时候，秦国太医令李醯（音“西”）把他给害死了，因为妒忌他的医术胜过自己。
陈致释义说，醯是醋的意思，古代人制酱时要加入醯，因此古代有一种把人做成肉酱的酷刑就叫“醢醯”（音“海西”），孔子的学生子路、汉代将军彭越，都被记载受到这种酷刑。
关于扁鹊，史料记载其实极少。比《史记》早一点的文字记载还有《韩非子》。但《韩非子》多讲寓言，所以未必可信。比如《韩非子·喻老》篇，讲扁鹊给人治病，用刀刺骨，刮骨治病。《史记·扁鹊仓公列传》里写过的一个扁鹊过齐的故事，《韩非子·喻老》篇也提到了，说扁鹊去见齐桓侯田午，也就是田氏代齐以后的齐桓侯而不是春秋时候的那个齐桓公。史书上有时候称齐桓侯为蔡桓公，只是因为他的都城在上蔡——按照战国习惯，国君以都城为号，跟春秋时候的蔡国并不是一回事，真正的蔡国在扁鹊时代已经被灭。扁鹊四诊桓侯，“疾在腠理”、“疾在血脉”、“疾在肠胃”、“疾在骨髓”，不一定那么准确，但还是有所依据。
《战国策》里也有少许扁鹊的史料。《战国策》记述了扁鹊见秦武王的故事。扁鹊准备给武王除病，左右大臣却说武王的病在“耳之前，目之下”，未必能够彻底治好，弄不好会让耳朵听不清，眼睛也看不见了。扁鹊听到武王转述这番话后就把手中的针摔到地上，说：您和懂的人商量，又让不懂的人掺和。如果像这样来管理秦政，恐怕就要误国了。
有书《鹖冠子》，据说是楚国一位隐居贵族所作，里面另写到一个扁鹊（秦越人）三兄弟的故事。扁鹊和魏王聊天，说自己有兄弟三人，其中最擅为医的是大哥，二哥其次，自己最差。魏王问他为什么这么说呢？扁鹊答：我大哥看病是“视神”，即看人的神气，病还没有成形就除掉了，所以他名气不大。二哥看病在“毫毛”，人有稍许症状就看出来了，所以“名不出于闾”，他的名气只在乡里流传。我呢，又动针，又看脉用药，还用刀来割开肌肤，所以在诸侯里面特别有名。
《鹖冠子》里边记载的扁鹊真实性如何？陈致偏向于存疑：“最近这些年很多人研究《鹖冠子》这本书，也有很多人相信它是真的。但是《鹖冠子》曾经是被怀疑的。因为史料的缺乏，这些都只可以作为参考。”
关于鹖冠子其人，《汉书·艺文志》只记载“楚人，居深山，以鹖为冠”。到了唐代，同为大文学家，韩愈《读〈鹖冠子〉》断为真籍十六篇，柳宗元却《辨〈鹖冠子〉》是伪书，后代学者也多以为伪。上世纪70年代长沙马王堆出土了汉墓楚帛之后，随着对其中佚籍《黄帝四经》的考古研究，一些学者开始认同《鹖冠子》不伪的结论。史学家李学勤考证鹖冠子的活动年代大约在战国晚期的前半，即公元前300～前240年左右。如果以此作为对照，《鹖冠子》对公元前310年去世的扁鹊的记载也就可信了些，毕竟他们生活的年代差异没有超过半个世纪。
春秋时期，秦国有医缓、医和。所以也有一个说法，指秦越人就是医缓，但是陈致认为这里边有一些附会。医缓、医和是春秋中期鲁成公时候的人。《左传》里面记载医缓给晋景公治病，景公梦见二竖子对话，医缓听后告知，其病在“肓之上，膏之下”，针不可及，药不可至，不可救也。“病入膏肓”的成语就从这个故事而来。
扁鹊通常被考据为生于公元前407年，卒于公元前310年。如果对春秋和战国的划分遵循公元前403年韩、赵、魏三家分晋为界，扁鹊就应是生于春秋末年而卒于战国中期的人。